731部队（关东军防疫给水部）的物资供给分为日本本土军工商社供货、海外进口、中国东北当地掠夺征用三类，全部经费来自关东军绝密军费，对外伪装为“防疫给水”名义采购，掩盖细菌武器研发的真实用途。
1、有档案明确记载的进口物资
- 福特汽车（美国福特）：1939年12月，石井四郎（加茂部队，731前身）正式向日本陆军省申请采购200辆福特汽车，申请经费116.2万日元，名义用于野外防疫、水源侦查、器材运输，实际服务野外细菌投放实验。该申请档案为日本陆军省原始公文，由课题组公开，是731部队海外采购的直接档案证据。车辆由日本军方统一进口之后调拨至哈尔滨平房基地，经大连港转运进入东北。
- 高精度科研光学仪器（德国蔡司）：日军通过三井物产等军方指定商社，以陆军战略物资名义进口德国蔡司显微镜，用于细菌观察、病理切片分析；同时大量使用日本奥林巴斯、尼康定制军用显微镜。战时前期可以完成进口，1943年后太平洋海上航路被封锁，海外仪器进口基本中断，只能依赖日本本土生产的设备补充。
- 菌种、病毒样本交换获取：德日轴心国之间通过潜艇、外交渠道交换生物样本，德国向日本转交部分日本无法获取的病毒毒株，不属于普通商品贸易进口，属于轴心国之间技术交换，无商业报关单据留存。
2、主要采购渠道与转运
- 中介商社：日本特殊工业株式会社、三井物产承接731部队的国内外采购，1940—1942档案记录大量订购培养罐、血清干燥机、冷冻机，其中大部分设备为日本国内制造，稀缺精密器材才走海外进口渠道。
- 运输口岸：进口物资运抵大连港，伪装为普通防疫物资，再通过中东铁路秘密转运哈尔滨平房731本部，全程关东军保密运输，普通海关不记录真实用途。
- 后期替代：1943—1945海上封锁之后，海外进口通道断绝，731部队一方面加大日本本土工厂订货，另一方面掠夺东北当地化工厂、医疗机构的试剂、耗材维持实验生产。
3、容易混淆的两点
- 大量实验设备（培养罐、石井式滤水机、血清干燥机）不是进口，是日本国内企业专门为731定制生产，哈尔滨市档案馆留存有这批订货的原始单据。
- 网络流传“大批量德国成套生化设备进口”说法，缺少中文官方馆藏一手报关、入库档案佐证；现有史料可以证实的是部分高端显微镜、少量零部件进口，以及德日之间病毒样本、技术情报交换。
4、战后反向交易
日本战败之后，美国德特里克堡以豁免战犯罪责为条件，支付25万日元，获取731部队人体实验报告、病理切片等全部实验数据，属于战后情报交易，不属于战时物资进口。