厦门植物园的特色植物集中在雨林世界与多肉植物区：雨林世界可看榕树绞杀、附生蕨类和猪笼草，多肉区汇集仙人掌科、块根类等沙生植物3000余种；园中还有虎颜花叶片大如蒲扇、紫花扁担杆和粉苞冬红等小众奇花。
一、雨林世界的特色植物群
垂直生态：底层蕨类、中层附生兰科、上层热带乔木，构成典型雨林结构。
绞杀现象：榕树缠绕宿主树逐步取而代之，是自然科普活教材。
奇趣植物：猪笼草、食虫植物、王莲池，以及叶片如蒲扇的虎颜花。
喷雾时段：5月至10月为9:30–11:30、14:30–16:30；10月至次年4月为9:00–11:00、14:00–16:00。
二、多肉植物区的沙生奇观
规模与收藏：多肉植物区约4万平方米，收集50余科3200余种，是国内最大室外沙生多肉展区。
明星植物：武伦柱、金球刺鱼虎仙人球、沙漠玫瑰、块根类多肉、龙舌兰、虎刺梅等。
专题展：2026年多肉植物展以“干旱植物的生存智慧”为主线，设沙漠玫瑰属、块根类、虎刺梅属、龙舌兰属、仙人掌科五大展馆，展示500余种。
三、其他专类园与隐藏特色植物
棕榈与湖景：万石湖、棕榈岛、南洋杉草坪、百花厅等构成核心景观，南洋杉草坪占地12万平方米。
小众花卉：紫花扁担杆藏在藤类植物区，5-6月开淡紫色花；粉苞冬红在西山园，粉色苞片形似绣球。
季节植物：姜园可看姜花，蔷薇园有会变色的睡莲，叉花草等也常见于园中。