【首次实现高空间分辨率表观遗传分析,耶鲁大学团队开发Spatial-CUT&Tag技术,或可提供治疗疾病的新途径】
在生命组织中,细胞的组织方式与功能之间存在强关联。常用的单细胞技术是通过把组织打散分离成单细胞来测序,但这样一来,组织中细胞的原本位置就会丢失。
事实上,最好的方法是能够直接在组织上观察基因表达及其调控机制。现有的空间组学技术已经可以实现空间转录组和蛋白组的分析,但对决定着基因组功能的染色质状态的高空间分辨率分析仍难以企及。
为此,耶鲁大学生物医学工程系樊荣教授团队开发了新的空间组学技术 Spatial-CUT&Tag,首次实现了“对基因表达机制方面的高空间分辨率分析”,并在组织原位得出了染色质状态调控基因表达的具体机制,为空间生物学这一新兴领域开拓了一个新的视角。
樊荣表示,“控制细胞类型和组织发育的潜在机制就是我们现在能够通过 Spatial-CUT&Tag 技术所‘看到’的东西。这是人类第一次在组织原位看到,是哪些组蛋白修饰直接控制组织中的全基因组基因表达,以及它们是如何运作的。”
相关论文以《空间组学技术 Spatial-CUT&Tag:细胞水平上空间分辨的染色质修饰分析》(Spatial-CUT&Tag: Spatially resolved chromatin modification profiling at the cellular level)为题发表在 Science 上,第一作者为耶鲁大学博士后邓彦翔,樊荣担任通讯作者。
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