麻省理工科技评论 22-07-30 20:15
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【2.14亿个结构:AlphaFold预测几乎所有蛋白质结构,并免费开放数据集】

近日,#Alphabet# 旗下公司 #DeepMind# 宣布:“AlphaFold 已能实现对科学上已知的、几乎所有编目蛋白质结构的预测。”

目前,AlphaFold DB 数据库的结构数量扩展到 2 亿个,物种包括动物、植物以及其他生物体,几乎覆盖了地球上所有进行过基因组测序的生物。这一进展将为科学探索开辟全新的路径。

该公司 CEO 德米斯·哈萨比斯(Demis Hassabis)在新闻发布会上表示:“你可以认为它涵盖了整个蛋白质宇宙。现在,我们正处于数字生物学新时代的开端。”

蛋白质是有机体内细胞的关键构成部分,也被称为支撑生命正常运转的基石。它具有一定的形状和空间结构,且形状与功能之间有密切的联系。因此,只有深入了解蛋白质结构,才能更好地掌握原理和功能,进一步推动生物科学的发展。

以前,研究人员需要付出几个月或几年的时间和精力,才能弄清蛋白质的结构。如今,凭借人工智能的力量,几秒钟内就能完成。

2020 年,DeepMind 推出一个名为 AlphaFold 的 AI 算法,它可以正确地完成蛋白质的结构测定。

2021 年,其与欧洲分子生物学实验室(European Molecular Biology Laboratory, EMBL)合作,建立了一个公开发布 AlphaFold 预测结果的可搜索数据库,即 AlphaFold DB,其公布的最初一组数据包含了 98% 的人类蛋白质。

据悉,AlphaFold 对蛋白质形状的预测,可以达到原子、尺寸和分钟级别的精确程度。

据哈萨比斯透露,还未推出 AlphaFold 以前,其已借鉴多名专业人士的意见,他们来自生命科学、伦理安全等不同领域,因此可帮助研究人员向全世界开源 AlphaFold。

他还称:“对我们的团队来说,AlphaFold 的成功尤其值得,因为它是我们构建过的最复杂的人工智能系统,需要多项关键创新,也因为它对下游产生了最有意义的影响。”

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