【地球超2亿蛋白质结构全预测,AlphaFold引爆「蛋白质全宇宙」】【新智元导读】今天,AlphaFold又让学术界沸腾了。DeepMind官宣,AlphaFold可以预测出2亿多个蛋白质结构,几乎覆盖了整个「蛋白质宇宙」。
来源:新智元
今天,DeepMind再次引爆学术界!
AlphaFold能够预测2亿多个蛋白质结构,实现数量级的重大飞跃。
最重要的是,全部免费开放!
在未来,预测蛋白质结构就如同使用「谷歌搜索引擎」一样简单。
DeepMind的首席执行官Demis Hassabis称,
「这个数据库涵盖了整个蛋白质宇宙,我们已经迈入数字生物学的全新时代!」
超2亿蛋白质结构,免费用
不可小觑的是,AlphaFold确实是学术界「海啸级」的存在,足以改变全人类。
2021年,DeepMind开源AlphaFold2后,震撼发布了AlphaFold蛋白质结构数据库(AlphaFold DB) 。
当时,98.5%的人类蛋白质结构全被AlphaFold2预测出来了。
而现在,DeepMind正式宣布该数据库已经从近100万扩大到2.14亿个结构,预测蛋白质结构数量也提升了200多倍!
几乎涵盖了地球上所有已进行过基因组测序的生物体。
据介绍,在超过2亿个蛋白质结构预测中,大约35%的结构具有高精度,并且已达到了实验手段获取的结构精度。
80%的结构可靠性足以用于多项后续分析。
让人兴奋的是,所有蛋白质三维结构都可以通过谷歌云公共数据集 (Google Cloud Public Datasets) 进行批量下载。
这次数据库的更新更是涵盖了植物、细菌、动物和其他微生物的蛋白质结构。
另外,DeepMind也将自身数据库集成到其他公共数据集,像Ensembl、UniProt 和 OpenTargets都可以使用。
目前,AlphaFold已被广泛使用,成为了世界各地成千上万实验室和大学的重要工具。
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