皱囊虫（𝘚𝘢𝘤𝘤𝘰𝘳𝘩𝘺𝘵𝘶𝘴）的化石来自陕西西乡县的早寒武纪地层，属于微体化石，最初一共发现了43个标本。皱囊虫自成一科（Saccorhytidae），属名来自拉丁语saccus（袋状的）和希腊语rhytis（有褶皱的），属下仅冠口皱囊虫（𝘚𝘢𝘤𝘤𝘰𝘳𝘩𝘺𝘵𝘶𝘴 𝘤𝘰𝘳𝘰𝘯𝘢𝘳𝘪𝘶𝘴）一个物种，种加词指其冠状的口部。

皱囊虫的体型很小，不过1毫米左右，身体呈两侧对称的半椭圆形，外表皮有V形纹路。皱囊虫的口位于腹面，由两圈放射状褶皱组成，内圈褶皱长有瘤状突起，口附近和背面还各有四个结瘤褶皱（nodulate rugae），身体中部前端有直立的刺，体锥面和身体后部有平行排列的小孔，可能长有刚毛。

皱囊虫的模式标本有八个锥状的开口，这些孔在发表时被认为是鳃孔，而鳃孔是后口动物总门（Deuterostomia）的特征，因此皱囊虫被认为是早期后口动物。但在2020年，有人提出皱囊虫化石的鳃孔其实是埋藏时产生的，它们实际上是蜕皮动物总门（Ecdysozoan）的早期成员，两年后更多标本的发现证实了，这些“鳃孔”实际上是刺断裂后的产物，皱囊虫其实上是一类浑身带刺的底栖小型蜕皮动物。