九一八事变的第二天，朱庆澜第一个向全国发出抗日通电，向蒋介石、汪精卫以及我党致电，希望大家停止内战，一致抗日。同时，朱庆澜也告诫家人，要记住“九一八”是国耻日，并把这天定为朱家的斋戒日，每年的这天，全家断炊戒斋，朱家后人至今仍遵守这段遗训。
1941年1月13日，朱庆澜因积劳成疾于西安病逝。陕西全省下半旗致哀，并遵其遗愿，葬于终南山下。其墓志及纪念碑皆藏于西安碑林博物馆。