2004年，山东济南，吴法宪病逝后，一张罕见的遗容，照片中的他身穿“六五式军服”，躺在鲜花中，工作人员正在为他盖上崭新的旗帜，看上去神态十分安详。

1971年，九一三事件后，吴法宪作为案件主犯之一被撤销了所有职务，并被隔离审查，五年后转到秦城监狱，在那里待了差不多五年的时间。

1981年，特别法庭判处作吴法宪有期徒刑17年，组织上鉴于他年事已高，而且战争年代身上留有伤痛，认罪悔罪态度良好。

同年的9月15日，被特批保外就医，在长子吴新潮和妻子陈绥圻的陪同下，他走出了监狱，在济南市区服完剩下的刑期。

因为吴法宪还处于服刑期，可以在济南市区内自由活动，但不得随意去到外地。直到1988年，他的刑期才彻底结束。

2004年10月17日，89岁的吴法宪在济南齐鲁医院去世。临终前，留下了两个遗愿：希望死后骨灰能藏回那个生他的小山村。再就是还能再穿一次军装。

家人为他召开了一个小型追悼会，追悼会上，吴法宪穿着55式军装，安详地躺在鲜花丛中，此外还覆盖了鲜艳的旗帜。

遗体火化后，他的长子吴新潮带着老母亲陈绥圻一道，将吴法宪的骨灰安葬于老家。