大部分的胆囊结石病人适合手术治疗，这是治疗胆囊结石最有效的方法。目前有两种方法，一种是腹腔镜下胆囊切除手术，由于切除胆囊会引起消化不良、胆总管结石、腹泻等一些不适，胆囊切除手术仅适用于胆囊无法保留的患者。目前治疗胆囊结石的新方法是内镜微创保胆取石术，它能够取出胆囊内的结石，又保留了胆囊，是符合人体生理功能的手术。内镜微创保胆手术使用目前最先进的电子胆道镜，用微创的方法，仅在腹壁戳2~3个孔，既可取出胆囊内的结石，又不切除胆囊，达到了保留器官、去除疾病的目的。
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