在日本，中药与针灸的应用更为普遍。日本的医史学术界认为，日本的传统医学具有1500年左右的历史，是以中国医学的传日作为起点的。可以说，直到200年多前，日本传统医学的主体，一直就是中国的中医学。不过，自江户时代中期以来，因为日本江户幕府闭关锁国的政策，令中医学在日本也进入独自发展阶段，进而使该体系出现了许多日本的特点。今天，日本流派的中医药应用被称为“汉方医学”；而以中医为源头的中药和针灸体系，则被统称为“东洋医学”。中医学与日本汉方或东洋医学的关系是同源异流，同根异枝。与多种精神心理疾病以及心身疾病相关的心身医疗领域，历来是日本汉方和针灸最为活跃的分野之一。