蓝莓医生 23-03-02 10:55
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一个开放的数据库:果蝇的大脑神经元图像

2 月 23 日在 eLife 杂志上发布了Janelia 的 FlyLight 项目团队研发的数万张果蝇大脑神经元图像,这是自 2012 年以来数十名 Janelians 成员多年努力的结晶。Janelia 一直致力于创造对整个科学界有用的免费资源。

八年来,FlyLight 项目团队和合作者对 74,000 多个果蝇大脑的神经元进行了解剖、标记和成像,这些大脑来自 5,000 多种不同的转基因果蝇品系。现在,这些图像可以免费获取,使科学家能够快速、轻松地找到他们需要的神经元,以测试有关神经系统工作原理的理论。

2006 年 Janelia 成立时,科学家们正在使用果蝇来了解神经系统,但研究人员没有足够精确的工具来研究单个神经元。2012 年,Janelia 发布了这些果蝇品系的第一代,即第 1 代 GAL4 启动子,以及显示大脑特定神经元所在位置的显微图像。但对于神经科学研究而言,第一代肯定不够精确。 因此,FlyLight 使用 Split-GAL4 方法从这些 GAL4 品系开发了果蝇品系,使科学家能够识别果蝇大脑中的单个神经元或单个细胞类型。

为了整合资源,FlyLight 团队使用了一种名为 MultiColor FlpOut (MCFO) 的技术, 生成了现在发布的 70,000 多张详细图像,这些成果在 8 台共聚焦显微镜上花费超过了 11 年的成像时间。

该图像资源的占用空间 (~105 TB) 超过了我们目前已知的标准公共数据存储库的实际限制。其资源库通过公开访问的网站 http://t.cn/A6CxtzSN免费使用。(什么是Split-GAL4,我让ChatGPT来回答,有点专业,外行可能看不懂)

发布于 江西