火麻仁味甘而滋润，能补中气、益血源，故可滋阴养血补虚，唯力较弱。用于心血不足，心阳不振而致心动悸、脉结代者，取其润燥补中、益气养血之功，助人参、麦冬、地黄、阿胶以养心血、助心气，如《伤寒论》炙甘草汤；
用于邪热羁留，损伤阴血而致手足心热甚于手足背，脉浮大，通下而热不退者，与炙甘草、麦冬、白芍合用，增强益阴生津、养血复脉之功，如《温病条辨》加减复脉汤；
若温热之邪，灼伤真阴而致神倦动风，时时欲脱者，常与白芍、阿胶、龟甲、鳖甲、鸡子黄配伍，共奏滋阴养血、潜阳息风之效，如《温病条辨》大定风珠。一般用量为10～20g。
现代还常用于慢性咽炎的治疗，此病属中医虚火喉痹范畴，为喉科常见病之一，其病程长，易反复发作，发病多与情绪有关。以咽部不适、微痛、有异物感、常有清咳动作为特征，肺肾阴虚是其主要病机。
《千金翼方》记载火麻仁对此症有良效，火麻仁性味甘平，归脾、胃、大肠经，具有润畅通便的功效。
《神农本草经》谓：“补中益气，久服肥健”，故本品尚有滋补作用。肺与大肠相表里，以火麻仁通腑润肺，以除肺脏虚火，又火麻仁含油脂（含脂肪油）可滋养肺胃津液。故火麻仁对虚火喉痹，特别是咽干者有较满意的疗效，唯病入阴虚较重时，须配伍养阴之品。