《新镌注解张仲景伤寒发微论》（明刻本）
许叔微的医著，据陈振孙的《直斋书录解题》记载，有《本事方》十卷、《伤寒歌》三卷、《治法》八十一篇、《仲景脉法三十六图》、《翼伤寒论》二卷、《辨类》五卷。《宝庆本草折衷》记载许叔微“尝著《伤寒歌》又名《伤寒明鉴》、《活人指南》以朱肱《活人书》纂成，又谓之《百分等秤》、《经效类例》。晚岁述《本事方》”。钱开礼《类证普济本事方序》说许叔微“手著《伤寒发微论》、《伤寒百证歌》、《议证二十二篇》、《仲景脉法》诸书，皆脍炙人口。至《本事方》其后焉者也。”现存的许叔微医著有《普济本事方》、《伤寒发微论》、《伤寒百证歌》、《伤寒九十论》四种。《普济本事方》在清代乾隆年间收入《四库全书》。书中的卷八、卷九为讨论伤寒的内容，已经收入《四库全书伤寒类医著集成》。《伤寒发微论》的成书年代，依钱开礼的说法，应在《普济本事方》之前，但具体年代不详。《伤寒发微论》的书名，钱开礼《类证普济本事方序》题作《议证二十二篇》，中国国家图书馆藏元刻本题作《新编张仲景注解伤寒发微论》，明万历三十九年乔山堂刘龙田刻本题作《新镌注解张仲景伤寒发微论》，《医藏书目》题作《伤寒发微》，《伤寒论辩证广注》题作《伤寒发微论》，今则通称为《伤寒发微论》，简称《发微论》。《伤寒发微论》的卷数，《医藏书目》作一卷，《读书敏求记》作三卷，《伤寒论辩证广注》作上下两卷，今则一般分为上下两卷。
此《新镌注解张仲景伤寒发微论》四卷，宋许叔微撰，明万历三十九年（1611)乔山堂刘龙田刻本。每半页九行，行十九字，小字双行字数同。四周单边，白口，单黑鱼尾。书口刻“伤寒百证”，封面页刻“张仲景，伤寒百证，许叔微註”“朱奉议，伤寒百问，钱闻礼註”。卷首为“太医院李存济题‘张仲景伤寒百证叙’”，次“重镌校正註解张仲景先生伤寒百证歌发微论目录”，新镌注解张仲景伤寒发微论卷之一题“白沙许叔微知可述”，新镌註解张仲景先生伤寒百证歌发微论二卷题“宋白沙许叔微知可述，明清邑后学杏泉雷顺春校证”。重镌註解仲景伤寒百证歌发微论卷之四题“宋白沙许叔微知可述，明清邑杏泉雷顺春校”，卷四末有“万历辛亥乔山堂刘龙田梓行”荷盖莲座牌记。
乔山堂刘龙田刻本《新镌注解张仲景伤寒发微论》四卷，其中第二、三全卷及第四卷的一部分为《伤寒百证歌》，《伤寒发微论》实不足两卷。陆心源在光绪七年（1881）“重雕元刻伤寒百证歌发微论叙”中认为：“明万历辛亥有乔山堂坊刻，合为四卷。证以元刊，不但面目全非，窜改亦复不少。此明人刊板之通病，医书尤甚者耳。余虑其误俗医而害人命也，重摹元刻以广其传，后之治医家言者，由是以求仲景之书，庶几免废人之诮乎。”
《伤寒发微论》在宋代的流传情况不详。元代有刊本传世。明代的刊本仅有万历年间乔山堂刘龙田本，因此明代的《医学源流》、《古今医统大全》均未提到此书。清代《四库全书》修成，《普济本事方》收入其中，许叔微和他的医著才渐为人知，始有人着意搜寻《伤寒发微论》，刊刻流传。