麻省理工科技评论 23-05-31 22:33
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#生物医学# 【给科学探索插上翅膀:实验室4.0时代即将到来 | DeepTech发起《生命科学实验室自动化研究报告》创新案例征集】

如何让已经分化的#细胞# 重新获得干细胞的能力?这个问题就好像如何让河水倒流一样困难,逆转自然进程。

日本科学家山中伸弥,根据已有的线索找到了 24 个在干细胞中高表达(含量高),但在分化细胞中低表达的调控因子。他的一个学生将这 24 个因子分别单独转入到了 24 株皮肤细胞中,但都没有成功获得干细胞。他的学生大胆提议,将这 24 个因子的基因同时转入到一个已经分化的皮肤细胞中,竟然真的让皮肤细胞变成了干细胞。

这 24 个因子中哪些是最重要的呢?他们从这 24 个因子中每次去掉一个因子,转入皮肤细胞中看能否让其变成干细胞,逐渐缩小范围,最终成功锁定了 4 个最重要的因子。只需要添加这 4 个因子,就可以让皮肤细胞转化成干细胞,重新获得分化潜能。山中伸弥团队发明了划时代的诱导多能干细胞(iPSC)技术,并以此获得 2012 年的诺奖。

从 24 个因子缩小到 4 个因子,假设他们每次都恰好去掉了正确的因子,并且没有实验操作失误,也需要 20 次实验以及 300 次转入基因的操作,其中包含上万次的加样、离心、涂板等各种重复性实验操作。

从孟德尔豌豆授粉发现遗传定律,#袁隆平# 培育杂交水稻,到山中伸弥的 iPSC 技术的发明,大量的重复性实验操作,是生命科学研究取得成就的必经之路。

随着多组学时代的到来,生命科学逐渐发展为大数据科学,越来越多的发现依赖于高通量实验。“人工高通量”,费时费力,容易出错。动辄几百上千个样品的 DNA 提取、蛋白表达量分析,许多新的信号通路、转录因子、药物靶点的发现依赖于高通量筛选。药企需要从上万甚至几十万的分子库中找到有活性的先导化合物,再优化出合适的临床前候选化合物。

而随着人造肉、替代蛋白、青蒿素、PHA、#DNA# 存储等各项应用发展,合成生物学被越来越多的应用到农业、食品、#医疗# 、生物基材料等领域。

#合成生物学# 的研究需要建立“设计-构建-测试-学习”的闭环。大规模构建完成后,测试成为一个限速步骤。一周可能做一个几百万的建库都没有太大问题,但是测试需要一个一个测,特别是酶、细胞工厂等等,每一个样品 30 分钟,一周最多就测几百个,以这个速度永远是测不完的。

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