中国疾病预防控制中心在中国29个省份的144家哨点医院对全国各年龄段的急性脑膜炎或脑炎患者进行了监测，然后对各种致病病原体检出率进行了排序，在我国急性脑膜炎或脑炎中，病毒和细菌检出率最高的排名分别是（排名从高到低）：

1.病毒
①肠道病毒（仅有EV71疫苗）
②乙脑病毒（有疫苗，分减毒和灭活）
③单纯疱疹病毒（无疫苗）
④腮腺炎病毒（有单腮或麻腮风联苗）

2.细菌
①脑膜炎球菌（有疫苗，目前四价结合是保护范围最广的）
②肺炎链球菌（目前国内保护范围最广的是13价，美国是20价，在研最高31价）
③金黄色葡萄球菌（国内在研，但预计是给术前接种的）
④大肠杆菌（没疫苗，霍乱疫苗理论上有效但没有数据支持）
⑤猪链球菌（？？？）
⑥b型流感嗜血杆菌（有单苗或四联、五联疫苗）
⑦结核分枝杆菌（卡介苗也算吧……）

在急性脑膜炎或脑炎病例中，5-17岁儿童中病毒检出率最高，以肠道病毒为主；5岁以下儿童细菌检出率最高，以肺炎链球菌为主要病原菌。

比较纠结的是……有70%的病例没有确定病原体，要知道我国此前发现很多急性脑膜炎或脑炎患者与李斯特菌（没疫苗）、B群链球菌（没疫苗）、新型隐球菌（没疫苗）、水痘带状疱疹病毒（有水痘疫苗和带状疱疹疫苗，前者均为减毒，后者分为减毒和重组）感染有关，不过也算是个比较常见的问题了。

图1：按年龄分组的四种病毒阳性率
图2：按时间分组的四种病毒阳性率