2021年1月27日，《中国纪检监察报》刊文披露，张琦利用担任海南省三亚市人民政府副市长，海南省旅游局局长，儋州市人民政府市长，儋州市委书记，海南省委常委、三亚市委书记、海口市委书记等职务上的便利，他滥用公权、以权谋利，巧立名目填海造地、违规开发，把土地资源变成肆意切割的蛋糕、捞钱赚钱的工具，是“靠地敛财”“坐地生财”“借岛发财”的典型。

为了谋求政绩，张琦不惜牺牲土地、海洋资源和生态环境。任儋州市委书记时，他违规推动海花岛项目，涉及填海总面积783公顷。

在他的极力推动下，儋州市政府及海洋部门通过“化整为零”的方式，将填海项目拆分成36个面积小于27公顷的子项目瞒天过海，使得不过关的项目得以推进，该禁止的项目得以审批，造成大面积珊瑚礁和白蝶贝被永久破坏。

根据简历，张琦2008年任儋州市长，2010年至2014年担任儋州市委书记。

2017年，中央第四环境保护督察组向海南省委、省政府进行反馈督察意见时指出，海南海域岸线自然生态和风貌破坏明显。沿海市县向海要地、向岸要房等情况严重，对局部生态环境造成明显影响或破坏。首个被点名的问题就是“儋州市政府及海洋部门化整为零违规审批海花岛填海项目，项目施工造成大面积珊瑚礁和白蝶贝受损”。

2018年《海南省贯彻落实国家海洋督察反馈意见整改方案》披露，2013年，儋州市政府及海洋部门在海花岛项目用海审批过程中，未进行关联性审核，对恒大集团旗下5家子公司申请的36宗项目分三批进行确权，共批准填海783.57公顷。上述审批所涉各单宗项目的地理位置紧密相连邻。项目备案号相连、海域使用权人具有关联性，且批准用海面积均不超过27公顷，规避国务院审批。