接上一条微博，今天Science发表了以Weill Cornell和Sloan Kettering领衔的全球多机构合作的重磅研究论文，这篇文章题目是“新型冠状病毒SARS-CoV-2蛋白酶抑制剂的开源研发”。这是COVID Moonshot（新冠登月计划）项目的部分结果。COVID Moonshot是一项完全开源的（实时公布研究结果）药物研发合作项目，旨在识别、合成和测试针对SARS-CoV-2主要蛋白酶Mpro的抑制剂，该蛋白酶是关键的抗病毒靶点。

这项研究根据以Mpro晶体结构为依据，理性设计化合物，从片段开始合成先导化合物。 研究采取了The crowdsourcing strategy（众包策略）沿着优化化合物的设计轨迹产生了几种关键化合物，包括成为主要先导系列的起始化合物。 研究还探索了另外三个化学结构上不同的先导系列，以涵盖多种化合物类型。

此后COVID Moonshot科学合作项目在多个机构应用高自动化分析方法检测了18000种化合物，包括2400种合成化合物，490种配体结构，22000种自由能变化和10000种生化检测，研究并实时公开这些结果。最近批准的抗病毒药物塩野義的Ensitrelvir活性是根据COVID Moonshot联盟的研究分析确定活性的。这项合作项目同时发现了一种抗病毒活性IC50 = 37 ± 2 nM的先导化合物，该化合物表现出有效的细胞活性，EC50 = 64 nM （A549-ACE2-TMPRSS2 细胞），并且无细胞毒性。 尽管所报道的化合物的药代动力学参数有待提高，但它是进一步开发高活性化合物的起点。

这项研究指出全球通力合作开源开发高效抗病毒药物、建立开放知识库、加速合作工作框架的建立取得了巨大成功，因此这是开源科学合作抗病毒药物研发的一个典范。研究希望在今后的合作中融入AI算法以便于检测蛋白质-配体相互作用、建立分子模拟以及快速结构测定相结合，以加速设计-制造-测试-分析周期。