渐冻症是一种罕见的神经系统变性疾病，上海治疗渐冻症的医院有很多，比较知名的有以下几家：

复旦大学附属华山医院：神经内科是华山医院的特色科室之一，是国内最早成立的神经内科之一，具有丰富的临床经验和先进的治疗技术。
上海交通大学医学院附属瑞金医院：瑞金医院神经内科也是国内知名的神经内科之一，拥有多位在渐冻症领域有丰富经验的专家。
复旦大学附属中山医院：中山医院神经内科是国家重点学科，具有雄厚的技术力量和丰富的临床经验，能够提供全面的渐冻症诊疗服务。
上海长征医院：长征医院神经内科也是国内知名的神经内科之一，具有多年的临床经验和先进的治疗技术，能够为患者提供优质的医疗服务。