薏苡仁还适用于湿热内蕴型化脓性疾病，如肺热成脓，胃肠热盛湿蕴而成脓，临床以全身或局部发热，咳唾腥臭脓痰或脓血积于胃肠不得排除而致的腹部剧痛，舌红苔腻，脉滑数或洪数为特点。
薏苡仁功善清热排脓，上能清肺热，下能利胃肠湿热。
古籍对薏苡仁的论述。
《药性论》曰：“主肺痿肺气，吐脓血，咳嗽涕唾上气”。
《本草正》曰：“薏苡，味甘淡，气微凉，性微降而渗……以其微降，故亦治咳嗽唾脓，利膈开胃”。故可治疗热盛湿蕴于肺金及胃肠，久而不愈，邪无出路，热腐成脓之症。
《备急千金要方》中苇茎汤治疗肺痈，《金匮要略》薏苡附子败酱散治疗肠痈，其中薏苡仁为主药，以奏清利湿热，排脓消肿之效。