重庆交通开投集团整合旗下公交集团、轨道集团、铁路集团、枢纽集团，新设成立重庆公共交通运营有限公司、重庆轨道交通运营有限公司，重组成立重庆交通建设管理有限公司、重庆交通资源开发有限公司四家专业子公司。
四家专业子公司将按照“多网一体化、分工专业化、经营市场化”原则，统筹推进“城市轨道、城际铁路、市域（郊）铁路、干线铁路+地面公交”多种方式融合一体化发展，主要职责如下：
以公交集团为主体，重组设立公交运营公司，统筹负责地面公交、出租车、长江索道、文旅融合和低空交通等运营，满足市民多样化出行需求。
整合轨道集团、铁路集团运营职能，重组设立轨道运营公司，受托运营城轨、快线、市域（郊）铁路，提高乘客满意度、运营可靠度和客流强度。
整合轨道集团、铁路集团、枢纽集团建设职能，重组设立建设管理公司，统筹负责基础设施建设任务，提高工程管理水平、提高建设质量水平。
以枢纽集团为主体，重组设立资源开发公司，统筹负责TOD综合开发、资源经营和增值服务，有力支撑集团可持续发展。