京都的原子弹投弹瞄准点——梅小路机车库（现在是京都铁道博物馆的一部分）。巨大的扇形机车库是空中非常好辨认的目标。广岛的原子弹瞄准点是太田川和元安川分流处，T字形的相生桥（实际爆点偏东）。

京都位于三面环山的盆地之中，地势平坦，市区街道路网为方格状，对于急需评测原子弹摧毁城市能力的美军来说，是最佳的原子弹投弹目标。但是美国陆军部长亨利·史汀生出于个人感情原因强烈反对用原子弹轰炸京都，因为他在1927-1929年担任菲律宾总督期间，曾经访问京都，对其美丽与优雅的古都风貌印象深刻，对京都有很深的感情。史汀生称，京都对日本人有巨大的感情价值和宗教意义，如果将其毁灭，将给战后管理日本带来很大的困难。

但是“曼哈顿工程”负责人格罗夫斯将军反驳说，日本的经济很大程度上依赖于小型工厂，这些工厂在战时生产大量的军备物品，京都市区里有264公顷已查明的和195公顷待查明的工业区，那里正在生产机床、精密机械、飞机零件、无线电和火控仪器，是最有价值的、最重大的军事目标。

史汀生仍然坚持己见，并对参谋总长马歇尔力陈不可轰炸京都的理由。马歇尔则不置可否，他认为即使不用原子弹轰炸京都，几个月后，进攻日本本土的“奥林匹克”战役和“冠冕”战役开始后，也得用燃烧弹和高爆弹把京都彻底摧毁。最后史汀生直接找到杜鲁门总统，劝他从原子弹目标清单上划掉了京都的名字，用造船工业基地长崎取而代之。实际上长崎地形多山，市区狭长，且分布在海湾两侧，并不是测试原子弹轰炸效果的理想目标。

而且在史汀生的努力下，京都此后仍然保留在禁止美国飞机进行常规轰炸的城市名单里，最终以基本完整无损的面目迎来了二战结束。图7~图12是大阪、神户等城市空袭受损区域的地图，京都基本完好。只有马町地区（图12右下角）、太秦地区（图12左侧）、西阵地区（图12中部，京都御所西侧、二条城北侧的L形红色区域）在三次很小规模的空袭中局部受损。

1945年（昭和20年）11月，战争结束三个月后，《朝日新闻》发表了一篇文章，内容是，京都和奈良之所以没有被空袭摧毁，是因为美国的兰登·华纳博士（Langdon Warner）制订了一份保护名单，建议美国政府将京都、奈良、镰仓等古城排除在空袭行动之外，以保护宝贵的文化财产。华纳博士也是一位亲日人士，后来被誉为“日本文化的恩人”，并通过学校教育在日本广为人知。 然而实际上并没有证据表明华纳博士曾经建议美国政府将京都和奈良排除在空袭行动之外，他本人也一直否认这一点。 但是这个故事很快传遍了日本，被当成一个不容置疑的事实。如今在镰仓站西口、茨城县大津町等地都有兰登·华纳的纪念碑（图15大津，图16镰仓）。奈良法隆寺还有兰登·华纳的报恩供养塔（图13、图14）

实际上在美国制订的轰炸日本180个城市的名单当中，奈良排在第80位，并不是不打算炸，而是不急着炸。轰炸中小城市的优先考虑顺序是，是否有密集的建筑物，是否有易燃建筑物，是否有军火工厂。如果日本没有及时投降，奈良也是会在1945年下半年被夷平的。

——华纳博士的这个故事，后来在80年代中日友好蜜月背景下，还出现了一个中国版本，说是梁思成向美军提出了保护京都和奈良古都的建议。

——日本人感谢的这个兰登·华纳，是哈佛大学的教授，专攻日本和中国艺术，以及东亚佛教艺术，也是哈佛大学福格艺术馆的东方艺术策展人，1927年当选为美国艺术与科学院院士。1924年，他从敦煌莫高窟的第335、321、323和320窟中，用胶水粘贴、石膏衬底的方法，盗揭窃走了26件唐代壁画，其中只有5件保存良好，其余的裂都成了碎片。他还盗走了敦煌第 328 窟的跪伏菩萨（图17）。1930-1935 年兰登·华纳担任堪萨斯城纳尔逊-阿特金斯艺术博物馆的亚洲艺术顾问，也帮助该博物馆弄到了很多从中国非法获得的艺术珍品，比如龙门石窟的文昭皇后礼佛图，易县八佛洼辽三彩罗汉组像，洛阳金村大墓成王方鼎、镂空龙虎饰卧蚕纹璧等等。

——兰登·华纳的确向美国陆军提交过一份建议保护的日本文物的清单，但是美军在作战当中根本不在乎。“华纳名单”当中的广岛城被原子弹摧毁，东京皇居、明治神宫、名古屋城、仙台城、冈山城、松山城、宇和岛城、宽永寺、浅草寺、永福寺、四天王寺等日本古迹都在空袭中被完全烧毁，首里城被美国海军战列舰直接用舰炮摧毁，姬路城、热田神宫等被部分烧毁