古巴华人多是店主或商贩，在古巴革命后自然成了“革命对象”。古巴政府自1961年开始没收华人店铺，至1969年彻底完成。之后随着中古关系及古巴经济的恶化，许多古巴华人打算回国。

古巴华人后代黄卓才向中国人民大学家书博物馆捐赠并出版了其父黄宝世的家书，其父自六十年代后期开始便一直试图回国定居，但终其一生也未能成功。黄卓才表示：
华侨搭乘中国货船回国无望，旅游观光回国无望，连亲人出机票援助回国也那么难，似乎每一条路都被堵死了，古巴政府的做法令人不可理喻。

至1988年中古关系恢复正常，华人方可因私回国。据古巴华人伍衮民回忆：
2004年时华区里头的唐人后裔搞了促进会，属于半私人半官方性质，可以安排华侨回中国，由华侨组织付机位和其他开支，7、8月时向我要身份证，以便去办手续，但我当时想，在香港已经没有家人，就放弃了。其实这安排很好，我听去过的人说，在广州接待得非常好，政府派人带大家去各处参观，侨联会代为打听和寻找亲人下落，安排见面，还向每人发放2000元人民币作为当地使用，非常好。我是自从离开中国之后，就再没有回去过了。

同南洋华人类似，在古巴也存在华人与土生混血华人的矛盾，原中华总会馆主席伍迎创回忆：
1995年12月安定堂推举我作为主席，我担任主席一直到现在，共17年了，安定堂从2002年开始也经营一间餐厅。由于安定堂主席的身份，我和华区的社团负责人有了往来。当时中华总会馆的主席是周一飞，第二副主席是李生，第三副主席黄文竞，周、李二人差不多同时死掉，大家推举黄文竞当主席但他不愿意，辞了职，结果没有人主持，古巴政府介入，派来两位华裔将军前来，准备将总会馆接管，这两位将军都是土生唐人仔，大家不愿意这样，于是想推举一个中国人出任主席，但多数华侨都已经七老八十，结果我便当上了主席，是很头痛的差事，这是三年前的事情。