抗战胜利后，蒋介石将“云南王”龙云强行解职，任其表弟卢汉为云南省政府主席。1949年8月，龙云策动卢汉在云南起义。

在1949年10月中华人民共和国成立时，龙云列入中央人民政府委员。1950年任西南军政委员会副主席，1953年任西南行政委员会副主席。

1954年，当选第一届全国人大代表。9月，他出席第一届全国人大第一次会议讨论宪法草案，期间并发言。1954年9月任国防委员会副主席。1954年12月任中国人民政治协商会议第二届全国委员会常务委员。1956年3月任民革中央副主席。

1957年初，在反右运动中，龙云曾在全国人大的云南组会议发言，主要表达了三层意思：“第一，苏联是我们社会主义阵营的老大哥。可是，他们太欺负我们的党和国家了，借我们的债，要高利息，要限期归还。

第二，云南解放以前，云南的农村已经遭到天灾人祸的破坏，解放后应该让人民休养生息。第三，我们凉山的彝族区域，还处在奴隶社会阶段，社会十分落后。应该循序渐进地把他们带进社会主义社会来。一来就搞阶级斗争，实行土地改革，我觉得为时尚早。”

发言后，原滇军旧部属张冲就很担心地私下对他说：“哎，你发言为什么不事前找我商量一下，你对于当前的形势一点也不明白，现在正在运动开始的时候，怎么可以随便泼冷水呢？”又说：“话说得是对的，可是这些话你只合私下向党中央说，怎么可以在群众中间乱说呢？”

卢汉回家后也说：“老主席（龙云）太孟浪，他说的话虽然在情在理，但是在‘反右’的风头上，怎么能说这些话呢？要挨，要挨！”之后龙云被扣上“反党”、“反社会主义”两项罪名，成为“大右派”，也受到昔日部下、之后的少数民族干部批判，被指为“土皇帝”、“家天下”。

1957年春被划为“右派”，成为少数民族著名六大右派之首。1958年2月1日中央撤销了龙云国防委员会副主席职务。1959年12月复任全国政协常委。1962年4月任政协第三届全国委员会常委。

1962年，龙云在北京去世。1980年其右派问题被平反。