徐霞客死后三年，全家被灭门：1641年，徐霞客在生命最后几个月，走不动路了，当地土司专门派人抬他回江阴老家，随病逝家中。仅仅4年后，清军入关，江阴城乱。在这个动荡的夏天，徐家的奴仆们拿起屠刀，将徐霞客的长子徐屺、侄子徐亮工一家五口、徐亮采一家十六口全部杀害，随后纵火烧毁了徐家祖宅，大量手稿被毁，仅余部分游记得以传世，很可惜啊，这就是震惊江南的“徐家灭门案”。
明朝末年，许多小农纷纷破产，为了生存，他们不得不投靠士绅大户为奴。在江南地区，这种“投靠”成风，大户人家往往“蓄奴数百”。虽然名义上朝廷禁止，但以“义子义女”为借口，这些仆人实则地位卑微世代为奴，形成了特殊的“奴籍”制度。
徐霞客在书中自述，在游历期间抓村民抬轿挑担，男村民逃了，他家抓妇女、儿童代劳。徐霞客游记里，他多次提到征用民夫，驱使殴打的情节。所以徐家有可能对待自己的奴仆也不好。
当1645年清军南下，明朝统治彻底崩溃时，那些底层“奴仆们”终于爆发。江南各地相继发生“奴变”，组织起“乌龙会”、“削鼻班”，纷纷向主家索要卖身契。一旦遭到拒绝，便刀兵相向。徐家被灭门，也是当时社会大背景的一个缩影。

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