男同性恋的形成可能受到胚胎发育期多种因素的影响，主要包括以下方面：

• 性激素水平异常：在胎儿发育过程中，性激素的分泌会影响大脑的性别分化，男同性恋者在胎儿期可能接触了相对较低水平的雄激素。胚胎发育关键期雄激素水平异常可能改变下丘脑性别分化，男性胎儿若经历母体应激导致的低雄激素环境，可能影响后期性取向发展。

• 缪勒管抑制因子相关缺陷：如前文所述，男性缪勒管发育异常的部分病因，如缪勒管抑制因子（MIF）基因（AMH基因）突变、MIF受体（AMHR2基因）突变等，可能不仅导致生殖系统结构异常，也与性取向的形成存在一定关联，不过这种关联尚未完全明确。

• 神经生物学因素：下丘脑前部间质核等与性行为相关的脑区，在部分同性恋者中呈现与异性恋者不同的结构特征，这些差异可能源于胚胎期性激素对神经发育的调控。

此外，还有研究表明，母亲生育期间面临巨大压力，可能会影响胎儿的激素环境，增加男孩成为同性恋的概率。不过，性取向是一个复杂的现象，涉及生理、心理和社会等多个层面因素，目前尚无单一明确的原因能完全解释男同性恋的形成。