南宋皇宫（又称南宋皇城）曾位于杭州凤凰山东麓，是南宋行在的政治中心，其毁灭是多重历史因素叠加的结果。‌‌

至元十四年（1277年），杭州城发生大规模火灾，火势蔓延至南宋皇城，主要殿宇被焚毁。这场火灾可能并非纯属偶然，部分学者推测元朝统治者有意借此抹除南宋统治象征以巩固政权。火灾后，元朝未对废墟进行维护，导致皇城逐渐荒废。‌‌

杭州并非没有南宋皇宫，而是‌南宋皇宫在元朝初期因火灾、政治拆除和宗教改建等原因彻底损毁，地面建筑已不复存在‌，但其遗址至今仍可寻迹。