很高兴和大家分享我们与杨建益教授团队合作、发表于 Nature Structural & Molecular Biology 的最新工作:CryoAtom improves model building for cryo-EM
http://t.cn/AXUlCTAj
CryoAtom 是一种基于深度学习、从冷冻电镜密度图全自动构建原子模型的计算方法。我们在 AlphaFold 架构基础上,引入了局部注意力机制与三维旋转位置编码,更好地利用密度图的局部信息;尤其在中低分辨率区域,能够帮助构建更完整、更准确的原子模型。
CryoAtom 的开发旨在缓解复杂生物大分子体系的建模瓶颈,并已成功用于多亚基蛋白质超复合体等体系的结构建模,也展现出识别未知蛋白、捕捉构象变化等潜力。希望这套数据驱动的自动化工具,能为结构生物学与机制研究带来更高效、更可靠的支持,推动更多新的发现。
代码已开源(GitHub):http://t.cn/AXUlCTAl
欢迎关注、试用与交流![音乐] http://t.cn/AXUlCsod
发布于 德国
