聂卫平之子孔令文原名聂云骢。1991年父母离婚后，随母亲孔祥明去日本生活，随母姓按孔府通天谱排字辈，改名为孔令文。

2003年和日本围棋九段棋手小林觉的女儿小林清芽结婚，育有一子孔德志，遵循孔氏家族字辈“德”字，拥有罕见的 "祖父 + 外公" 围棋九段组合基因，祖母则是围棋八段，还与姑姑聂云菲同年出生。

约11年前离婚，另与现任妻子育有次子孔德辰。