1997年，长江和记实业有限公司，经国际公开招标，成功赢得了巴拿马运河太平洋侧的巴尔博亚港、大西洋侧的克里斯托瓦尔港为期25年的特许经营权。
2021年，依照原合同中规定的自动续约条款，长和公司同巴拿马政府顺利达成了续约协议，从而将特许经营权延长至2047年。
2025年初，巴拿马审计长办公室展开了对该港口合同的专项审计工作。不久后，巴拿马的检察总长及审计总长相继发表声明，指责该合同在程序上存在缺陷，导致国家蒙受了超过10亿美元的税收损失，并对当年批准该合同的官员发出了提起法律诉讼的警告。
2026年1月29日，巴拿马最高法院通过其官方社交媒体平台发布声明，宣布1997年授权长和负责港口运营的法律及其后续的扩展修订案“违宪”。该裁决的依据在于，该合同赋予长和的权益“过分且不成比例”，从而对国家的主权及财政收入造成了损害。此裁决为最终裁决。
2026年1月30日，中国外交部发言人明确表态，中国将不惜一切必要手段，坚定捍卫我国企业合法、正当的权益。香港特别行政区政府亦于当日发布声明，对该裁决表达出强烈的愤慨与坚定的抵制态度，并郑重警告称，此举将对当地的商业环境及投资者的信心造成严重损害。长和集团也发布声明，对该裁决表示坚决抵制，指出其“违背诚信原则，背离合约精神”，并宣布将保留采取一切法律手段的权利。
2026年2月3日，长和集团旗下的巴拿马港口公司，依据特许经营协议及国际商会仲裁规则，正式向巴拿马共和国发起了国际仲裁程序。
2026年2月23日，巴拿马最高法院的裁决在官方公报上正式公布并生效，巴拿马政府迅速采取措施，基于“紧急社会公共利益需求”的考量，总统穆利诺签署行政命令，宣布对两座港口实施“临时接管”。政府代表擅自闯入港口码头，宣布即刻终止长和公司的特许经营权，并责令巴拿马港口公司即刻暂停所有运营活动。员工需服从政府安排，否则将面临刑事起诉。港口内的一切移动资产，包括起重机、车辆、办公设施以及软件系统，均已被巴拿马海事局“接管”。为确保港口运营不间断，巴拿马政府立即任命了过渡时期的临时运营商。太平洋侧的巴尔博亚港由丹麦马士基集团子公司的APM码头公司负责管理，而大西洋侧的克里斯托瓦尔港交由瑞士地中海航运集团旗下的码头投资公司运营。此过渡期最长可持续18个月。
2026年3月6日，长和公司宣布，已对法律应对措施进行了强化升级。除已启动的国际仲裁程序外，公司亦向巴拿马国内行政机构提交了申诉，旨在促使对导致其资产被查封的行政裁决进行复审。
3月9日，交通运输部就国际航运经营行为分别约谈了马士基集团、地中海航运公司有关负责人。