Science今天发表了Jon Cohen一篇文章,报道了新型冠状病毒SARS-CoV-2起源研究的一个关键信息的出处。三年前,法国巴斯德所科学家Débarre通过数据挖掘发现了国家CDC在当月发表Nature时无意中在Nature预印版数据库Research Square上传了GISAID链接,提供了的华南海鲜市场动物样本测序的原始数据(http://t.cn/A6CBzORT),这些数据被Débarre发现后,又被迅速删除,引起了国际关注(http://t.cn/A6CBzORT)。之后Débarre的研究发表在了Cell上(http://t.cn/AXfZGgQf),成为了病毒起源跨种传播证据链最重要的一项科学研究。
这项研究中详细分析了华南海鲜市场的摊位信息,成为了关键资料。而这些摊位信息实际上来自于2021年9月14日微信公众号文章公布的华南海鲜市场通过微信支付和支付宝支付的摊主信息细节(图2)。这是第一个被公布的详细华南海鲜市场摊位地图和感染摊主及动物信息。早在2021年2月,世界卫生组织WHO公布了疫情起源调查报告(http://t.cn/AXfZGgQV),这个报告首度公布了华南海鲜市场感染地图,但是该地图并没有显示任何检测阳性的动物。2023年国家CDC上传到的GISAID数据首次显示了华南海鲜市场有大量感染SARS-CoV-2的动物,其中racoon dog(貉)富集了大量病毒。而2021年9月14日微信公众号文章验证了上述两个证据(即WHO公布的摊位地图和CDC上传的原始数据),并且通过微信和支付宝信息绘制了病毒最早的传播链。
今天法国科学家Débarre将上述信息进行了整合,绘制了系统的摊位动物感染和人间传播的地图,之后将文章上传到了数据库Pandemonium(图3)。Science将这项研究进行了报道。
疫情全球大流行已经发生整整六年,但我们依然不知道SARS-CoV-2起源;然而全球顶级的病毒进化学家依然在孜孜不倦地挖掘证据并拼接证据链,试图从分子病毒学角度阐明病毒跨种传播的过程,这种精神值得敬佩。但真正的核心证据,即2019年12月测序数据可能很难最终被病毒学界获得(如果不是CDC无意中在发表Nature过程中上传数据,貉的病毒测序数据也不会被公布),这是目前研究病毒起源的最大障碍。
