武夷山国家公园整合了原有各类自然保护地及其连接区域，涵盖武夷山南坡、北坡最精华的区域，确保武夷山的中亚热带森林生态系统，九曲溪、铅山河等河流湿地生态系统，黄腹角雉、金斑喙凤蝶、黑麂和水松等重点保护野生动物栖息地，武夷山大峡谷、丹霞地貌景观以及理学文化、古闽族文化等历史文化遗迹得到完整保护欲传承，是我国唯一一个既是世界生物圈保护区，又是世界文化与自然双遗产的国家公园。