nyouyou 26-04-26 11:03

娱乐博主潜水多了,经常看到一个说法“粉黑都满意” -- 这个好像也特适用于我们学科耶。

冷冻电镜技术横空出世(这真的是game changer),三位在该领域深耕半世纪的前辈得诺奖,无知者:“看,他们只会利用电镜发论文灌水”;结构生物学研究人员则是喜大普奔,终于不用把宝贵的时间用在令人绝望的结晶这一步了,我们被赋能了,加速了理解生命、药物研发的进程;

AlphaFold突破,无知者:“颜宁的专业被取代了,混不下去回国了”【不是,这么说话的人有没有意识到自己心里是多崇洋媚外啊,合着潜意识就觉得出国才是升,只有混不下去才能回国,而不是因为更好的环境?都21世纪第三个十年了,某些人骨子里的那些自卑就别无知无畏地丢人现眼了】;专业人员:AI赋能,终于又能摆脱一部分重复劳动了,可惜AF还不太行,好多预测不出来或者预测不准。

我们4曰20日周一的Cell Chemical Biology是把之前早就放在预印本的荷塘月色鉴定出来的若干糖纤维正式发表,这不仅仅是报道结构,更是把自然界生物世界不为人知的一隅呈现出来,换言之,是发现了此前生物世界完全不知道的物质,直观看到了这些,特别是完全没有蛋白的纯糖纤维,毫无基因组序列可以参考,既激动人心,研究起来又困难重重。下一步就是三连问:它们是什么?它们做什么?它们从哪里来?(生物本质、生物功能、生物合成通路),这就是我们实验室正在吭哧吭哧做的。所以我们才说#cryoseek 酷寻# 是一个结构优先的发现策略#CryoSeek: A structure-first paradigm for discovery#

而紧接着上线的Science论文(投稿前全文可在#浪淘沙预印本平台# 免费开放获取)则是确立了一个研究体系,可以就其中我们命名为TLP-4的一类糖纤维展开系统研究了。高达0.2纳米分辨率的结构令我们精确地看到每一种糖,每一个结合的水分子,每一个金属离子--这在此前难以想象。而这个金藻株系连基因组序列都还没有,所以我们要先测序,才能开展后续很多实验。即便如此,多糖的序列并不能从基因组推测出来,AlphaFold连序列都没有,怎么预测啊?就算有序列,之前没结构,它也没法被训练啊[酷]

我们现在要做的就是尽可能从一切重复劳动中进一步被解放,这是另外一个故事,现在要开会去了,晚上有空接着写。要听后事如何,且听下回分解

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发布于 北京