虽然目前市面上百分之七十以上的观赏樱是日本品种，但日本的原生樱亚属植物其实很少，共有如下10种原生樱花（樱亚属 Prunus subg. Cerasus）：
1.丁字樱 Prunus apetala
分布：日本特有种。原生范围仅限于日本本州、九州。

2.豆樱 Prunus incisa
分布：日本特有种。仅分布于日本本州关东、中部地区。

3.大岛樱 Prunus speciosa
分布：日本特有种。原生范围包括日本伊豆诸岛，但有记录显示分布于韩国济州岛。

4.霞樱 Prunus verecunda
分布：日本特有种。原生范围仅限于日本北海道、本州、九州、四国。

5.山樱 Prunus serrulata
分布：日本本州中部、南部至南西诸岛，于朝鲜半岛的分布有争议。

6.大叶早樱 Prunus pendula
分布：日本中部至南部，韩国济州岛。

7.深山樱 Prunus maximowiczii
分布：日本北海道至九州、朝鲜半岛、中国东北、俄罗斯远东。

8.大山樱 Prunus sargentii
分布：日本北海道、本州，韩国。俄罗斯远东千岛群岛、萨哈林、滨海边疆区。

9.高岭樱 Prunus nipponica
分布：日本北海道、本州中部，及俄罗斯萨哈林、千岛群岛。

10.寒绯樱 Prunus campanulata
分布：琉球群岛、中国华南、华东、台湾地区、越南。

其中，日本独有的原生樱亚属植物只有3或4种。而中国则拥有约38至50种原生樱亚属植物（不同统计口径下数据有差异），其中约29种为仅分布于此的特有种。