2016年，高畑裕太因涉嫌强奸一名40岁左右的酒店女员工被群马县警逮捕，后因和解作不起诉决定被释放。
当时他参演多部电视剧受到波及，其母高畑淳子也出面谢罪。
事件发生10年后，今日高畑裕太发表长篇声明，承认当年与女性发生关系，但否认强奸。
“关于当天详细经过，出于隐私考虑，我不便在这里进行说明。但事实与报道之间存在巨大偏差。首先，与酒店女性工作人员发生关系这一点本身属实。但并不存在媒体报道中所谓构成‘性暴力’的行为，也没有实施伴随伤害的暴力行为。当时曾有报道称，我‘打电话到前台要求送牙刷，并将前来的女性强行拖入房间’，但并不存在这样的事实。
此外，在我于警署接受讯问期间，当时所属事务所及拍摄相关人员正在警署等待时，一名自称是该酒店女员工“男友”的男子冲进警署大声叫嚷。后来确认，此人曾与黑社会组织有关联。同时也确认，他曾向我当时所属事务所及相关人士提出高额金钱要求。我认为，这样的背景经过，是理解本案整体情况时不可忽视的重要因素。
另外，虽然我本人确实接受了和解，但那只是基于当时局势下，考虑到长期处于不稳定状态的风险后所作出的现实判断。如果当时被正式起诉，我依然会坚持主张自己无罪。若仅以‘因为和解所以不起诉’这样简单的结构来理解本案，并不符合刑事程序的实际情况。由于我当时轻率的行为，给许多人造成巨大困扰，这是无可辩驳的事实，没有任何辩解余地。当年报道形成的公众印象，至今依旧固定地贴在我身上，这也确实成为我今后人生与活动中的巨大限制。”