杨昀还跟肖飞有关联。2025年，中日友好医院胸外科副主任医师肖飞被妻子举报，经查存在违反手术安全管理制度、擅自中断手术并离开手术室、在婚姻关系存续期间与他人保持不正当关系等问题。肖飞已被开除党籍、解除聘用关系。两人合作发表过论文，杨昀为共同通讯作者之一。
​博士生读了五年退学，导师还在跟外部人员合作。