明朝初年是承认了元朝的正统性，这是一个事实。但总是强调这一点的那些人不会告诉你，到嘉靖年间，忽必烈被从“历代帝王庙”中移了出去，标志着否定了元朝的正统地位。

之所以如此，是因为正统性评价这类意识形态，话语权很大程度上掌握在文人（儒家）手中。而不是皇帝一个人能说了算的。实际上从朱元璋各种言论综合来看，他是很不情愿承认元朝的。但问题在于，治理国家离不开那些文臣，而明朝开国文官集团核心，如李善长、刘基、宋濂等人，都有元朝的科举功能、在元朝为官的经历，否定元朝，就等于把他们都归为“贰臣”了，这是不得不做的一个妥协。这也是大多数朝代，都承认前朝的一个原因。思想意识上的推翻，远比政权上的推翻要滞后。

而只有等时间足够长了，掌握话语权的文人集团已经更新换代到彻底跟前朝扯不上关系，才能卸下这个负担。

而对清朝的评价，历史包袱比元朝更加沉重。北洋政府本身就脱胎于清朝的臣属，后来还有“团结史观”的作用。明朝否定元朝用了150年，否定清朝用的时间，按说至少不会比这个短。