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【中国儿童先天性心脏病基因组研究计划发现先心病致病新基因及其遗传机制】
贺林院士发起了人类单靶标基因组计划-中国儿童先心病基因组研究计划,项目组针对我国354个先天性心脏病(CHD)核心家系进行了全基因组测序,进而整合单细胞转录组数据以及模型动物表型分析等,多维度筛选出高可信度CHD风险基因,构建了亚洲人群最大的先心病家系遗传病因图谱。
本研究中共检测到393个编码区的新发变异,其中16个符合美国医学遗传学与基因组学学会制定的致病性分级标准。结合两种新发变异优先排序方法,我们鉴定出11个重叠候选基因,其中PTPN11、SETD2 和RASAL2 三个基因在胎儿心脏发育早期的单细胞RNA测序数据中表现出较高表达水平。值得注意的是,本研究还发现了一个可能具有致病作用的非编码新发单核苷酸变异(chr18:24040823),该变异可调控SOX13 的表达进而导致疾病发生。同时,本研究在多个家系中观察到LAMA5 和SCN4A 基因同时携带复合杂合单核苷酸变异。此外,本研究还鉴定到一个包含YWHAE 基因的致病性新发长片段重复变异,YWHAE 基因是一个可能参与先天性心脏病发病过程的尚未报道的心脏发育相关新基因。更为重要的是,进一步整合先天性心脏病患者单细胞数据与动物模型表型数据库,本研究筛选出25个与异常心血管表型相关的新基因,提示这些基因可能在先天性心脏病发生过程中发挥重要作用。
发布于 上海
