【2026 Science x AI Summit 系列演讲切片第九期—兰迪·谢克曼(Randy Schekman)】
在2026 Science x AI Summit上,2013年诺贝尔生理学或医学奖得主兰迪·谢克曼(Randy Schekman)系统阐述了蛋白质折叠研究从实验科学迈向AI驱动的历史路径。
他指出:没有经过严格实验验证的高质量数据,任何AI模型都无法产生可靠的结构预测,而AI的突破性进展,本质上是数十年实验数据积累的必然结果。
谢克曼回顾了结构生物学的关键里程碑:1950年代Frederick Sanger完成胰岛素测序,1960年Max Peruz与John Kendrew利用X射线晶体学解出血红蛋白三维结构,以及Levinthal悖论对随机搜索无效性的理论揭示。这些工作共同确立了“实验验证优先”的基本原则。
此后数十年,全球科学家通过X射线晶体学、核磁共振和冷冻电镜,逐一解析数万种蛋白质结构,汇聚成蛋白质数据库(PDB)。两年一度的CASP竞赛为算法提供了公平、严格的验证平台。
转折点出现在2020年:DeepMind开发的AlphaFold2在CASP中预测精度接近实验分辨率,2021年更发布了超过两亿五千万个蛋白质的预测结构。谢克曼强调,这一成就完全依赖于数十年积累的公开实验数据库。没有验证,就没有预测。
与此同时,David Baker团队利用Rosetta及RF Diffusion算法,不仅预测天然结构,更能从头设计自然界不存在的新型蛋白质,应用于高亲和力抗体与超高效催化酶等领域。2024年,诺贝尔化学奖授予了Baker,以表彰他在蛋白质计算设计与结构预测方面的开创性贡献。
谢克曼最后指出:无论是数学定理的形式化证明,还是蛋白质结构的实验解析,可信智能的基础永远是“可验证的事实”。
这一理念与SAIR基金会“验证优先”的使命高度契合,无论是数学定理的形式化证明,还是蛋白质结构的实验解析,科学进步的根基都在于可追溯、可重复的验证体系。
“蛋白质结构的预测不取决于算力的堆砌,而取决于每一个原子位置能否被实验验证所校准。”——SAIR,与思考者同行。
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