AI模型精准预测RNA三维结构,表现媲美“阿尔法折叠3” 🧬
美国弗吉尼亚理工大学团队开发出AI模型 “RNAbpFlow” ,在RNA结构预测任务中表现可媲美谷歌DeepMind的“阿尔法折叠3”,且无需依赖海量进化序列数据库。相关研究发表于 《自然·方法》 。
🎯 性能如何?
国际通用基准盲测中,RNAbpFlow成功预测了14个RNA目标中的12个正确结构,而“阿尔法折叠3”仅预测了8个。更重要的是,RNAbpFlow无需依赖大规模进化序列数据库,仅利用RNA序列及碱基配对信息即可完成预测。
🔬 技术原理
RNAbpFlow采用生成式AI领域广泛应用的流匹配技术,从完全随机的噪声出发,在碱基配对信息引导下逐步折叠形成正确构象,并可一次生成多个不同结构,更好地反映RNA分子的动态变化。
💊 对药物研发的意义
快速准确的RNA结构预测,有望加速RNA靶向药物研发。目前治疗脊髓性肌萎缩症的药物risdiplam,正是通过靶向RNA特定折叠结构起效的。该技术或将为亨廷顿病、渐冻症、癌症、病毒感染等疾病带来突破性疗法。
团队已利用该方法预测了新冠病毒基因组中的一个保守RNA结构元件及实验室构建核酶等分子的结构。
对于尺寸更大、结构更复杂的RNA,现有依赖进化信息的预测平台仍具优势;RNAbpFlow则在数据稀缺的复杂场景中表现更为突出。研究团队正开发升级版本,并计划参加今年夏季的CASP国际结构预测竞赛。
免责声明:本文仅为健康科普,不构成诊疗建议。
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