使用近代比较神话学的方法研究日本神话，最初的代表作是高木敏雄《比较神话学》。
后来的石田英一郎（《河童驹引考》）、冈正雄、大林太良的泛世界的类型学的研究，为现在的日本神话研究提供了经典的范式。
简单说，就是通过神话的类比，归纳出文化综合体的地域带分布规律。比如说支配神的起源：从天上降临到地上的“降临型”神话，主要见于北亚和非洲的畜牧民族之中；而从农作物等特殊的“身体”中诞生的“尸化型”神话，则见于东南亚、小亚细亚、印度、太平洋圈的南北美的农耕民族之中。

近年，吉田敦彦介绍法国比较神话学家Georges Dumézil的“三机能体系”的神话理论，该理论主张构成古代社会的有祭司、战士、生产者三个阶级，这三个阶级在古代神话中与三种身份分别对应。
这种理论广泛适用于印欧系的原始神话，吉田敦彦也尝试套到日本的神话解释中去，比如认为三神器中的镜代表宗教、剑代表军事、玉代表农业等。——但是这种尝试有很强的局限性。因为日本文化不是典型的征服民族的社会类型。