在烘干的时候，注意火候的拿捏。在黄连逐渐变干的时候，烘的火力也应该随着黄连的干燥程度而减小，一般烘干的黄连根状茎容易折断，干到容易折断、断面呈甘草色的时候就意味着黄连烘干了，便可以直接出炕。趁热取下来放在竹制的槽笼里来回推拉，也可以放在铁质的撞桶里用力的旋转、推撞，这样就可以撞去黄连残存的须根、粗皮、鳞芽以及叶柄。推撞之后再倒出，拣去石子、土粒，扬去灰渣，成品药材就做好了。
如果黄连的生产面积大而又有条件的，可以建一个黄连烘房进行烘干。一般情况下，每亩黄连地可以生产干黄连大约75~211千克，高产的黄连地每亩可以达到311千克。
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