16世纪30年代，印度古吉拉特苏丹国接连遭受葡萄牙袭扰，两次遣使向伊斯坦布尔求援，奥斯曼都派出了远洋舰队赴印度近海协同作战。苏门答腊北部的亚齐长期受葡萄牙封锁，1564年，亚齐苏丹遣使面见苏莱曼大帝，提出愿意纳贡归附，以换取奥斯曼出兵驱逐葡萄牙人。彼时，苏莱曼大帝正与欧洲、波斯两线作战，无力远征，但应允输出火器、教官等。塞利姆二世继位后正式编组远洋舰队，奔赴亚齐阻击葡萄牙人。

这些军事行动的实际效果并不尽如人意。奥斯曼人擅长地中海式的桨帆船作战，面对葡萄牙人的风帆战舰和海上堡垒，占不到便宜。但奥斯曼的目的本来就不是称霸印度洋，而是通过扶持当地政权牵制葡萄牙的扩张势头，为传统商路赢得空间。就此而言，奥斯曼的战略是成功的。哪怕日后荷兰、法国、英国等欧洲列强相继竞逐印度洋，也未能掐断奥斯曼主导的红海航路，香料贸易持续运转，直至1869年苏伊士运河开通才遭受致命打击。

同时，奥斯曼帝国通过经营印度洋，开阔了视野，丰富了知识。正是基于开拓印度洋积累的航海技术、地理信息、各地风情等，奥斯曼学者编纂了两部重量级著作《大海之书》和《大洋之书》。奥斯曼人还绘制了大量地图，质量不亚于同时期欧洲人制作的地图。