物理芝士数学酱 26-03-10 17:39
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#今天要来点生物学吗?#

昨天提到有团队模拟了果蝇的大脑 http://t.cn/AXVoi8sl

今天刚刚发表的这篇论文(Luthey-Schulten等人,《细胞》2026, http://t.cn/AXVoi8sj)第一次构建了完整的数字活细胞。

对象使用了JCVI-Syn3A——一种基因数量少于500个的合成最小细菌。

该论文对完整的105分钟细胞周期进行了三维时间模拟,模拟内容包括DNA复制、蛋白质翻译、代谢和细胞分裂。论文追踪了每个基因、蛋白质、RNA和化学反应在物理空间中的运动轨迹。

耗时数年,使用多块GPU。每次运行需要6天的计算时间。

这是最简单的细胞。同时不处理多顺反纵子的共转录;每个基因都假装是独立转录的。

人类细胞约有2万个基因。它存在于组织中。它与邻近细胞相互作用。它会分化。它对药物的反应取决于我们尚未完全了解的具体情况。

对最小细胞进行机制模拟,需 6 个 GPU 天,却只能模拟 105 分钟的生物学过程。这根本无法扩展到人类细胞。复杂度并非相差 40 倍,而是呈指数级增长。 http://t.cn/AXVoimKR

发布于 黑龙江