3月23日，日本海上自卫队正式解散了长期存在的“护卫舰队”，成立了新的“水上舰队”，将四个护卫舰队合并为三个水面作战舰队。每个舰队由一艘直升机驱逐舰（DDH）、两艘宙斯盾驱逐舰（DDG）和五艘通用驱逐舰（DD）组成。
重组后，第一水面作战群驻扎在横须贺，以直升机航母“出云”号 （DDH 183）为旗舰；第二水面作战群驻扎在吴港，以“加贺” 号（DDH 184）为旗舰；第三水面作战群总部设在舞鹤，以“日向”号（DDH 181）为旗舰。这是自1954年以来最彻底的组织改革。海上自卫队还成立了新的“水陆両用戦机雷戦群”，总部设在九州岛长崎县佐世保。该舰队整合了扫雷舰、运输舰和两栖作战能力，旗舰为日向级直升机驱逐舰伊势号（DDH 182）。

改革还包括建立新的“信息战/作战司令部”（情报作戦集団），反映了向一体化、多域作战的转变。