2016年《Molecular Psychiatry》动物实验证实肠道菌群失调与抑郁存在因果关联：抑郁患者肠道菌群构成异于健康人，将抑郁患者粪便菌群移植给无菌小鼠后，小鼠出现抑郁样行为；菌群会扰乱宿主碳水、氨基酸代谢，经肠-脑轴影响情绪，明确代谢介导通路是菌群诱发抑郁的关键机制。
2018年《Journal of Affective Disorders》临床研究进一步验证转化价值：粪菌移植可改善伴肠胃症状抑郁症患者的低落、焦虑，人体超九成情绪调控物质血清素由肠道合成，菌群能直接合成神经递质前体；2016—2018年专用菌液移植临床有效率超64%，证实调节肠道菌群是抑郁症潜在治疗方向。